در کتاب فقه الحکومه خواهیم دید که فقهای شیعه در اصل بحث ولایت فقیه شکی ندارند و اگر اختلافی هست بر سر حدود و اختیارات آن است زیرا با استناد به آیات و روایات، ارتباط داشتن دیانت و سیاست، ادله ارتباط دین با سیاست، شواهدی از قرآن مبنی بر ارتباط دین و سیاست، مهندسی دین در باب حکومت، مهندسی دین برای حکومت در عصر غیبت کبرای حضرت ولیعصر(عج)، ولایت فقیه(نظریهها، پیشینه، واژهها، ادله و شبهات)، نقش مردم در حکومت دینی، ویژگیهای ولی فقیه، محدوده ولایت فقیه، و پاسخ به شبهات درباره ولایت فقیه از جمله مباحث این کتاب است.
قرار بر این مدار است که به فضل حق «فقه الحکومة » را طرح کنیم؛ آن هم با این نگاه که اولاً مدل حکومت از نگاه دین کدام است و ثانیاً کیفیت حکومت از نگاه دین چگونه است و ملک داری در عرصۀ فرهنگ و سیاست و اقتصاد چگونه باید باشد.
تفاوت اساسی این بحث با مباحثی که در دانشگاهها مطرح می شود، این است که اینجا به سبک فقه جواهری وارد مباحث می شویم؛ یعنی هیچ سخنی را بدون مدرک نمی پذیریم و مدرک را بررسی خواهیم کرد. این بحث کاملاً بحث طلبگی و به سبک سایر مباحث فقهی است.