Filosofia é a questão principal da ciência, sempre que preferimos investigar um assunto do ponto de vista da filosofia, os generais e as principais perguntas sobre ele seriam feitas pela mente dos sábios. Embora hoje a filosofia tenha sido considerada como uma ciência independente em todo o mundo, as ciências naturais têm tido origem na filosofia natural. A química é uma das ciências naturais em que a utilização dos elementos, átomos, moléculas e outras estruturas químicas, além de seu comportamento nas reações e suas características, é feita por ela. Infelizmente, a química teve alguns lados obscuros na história e tem sido ignorada por outros estudiosos na medida em que alguns dos estudiosos preferem não considerar a química ou sua filosofia como uma ciência independente. Não considerar a química e sua filosofia autonomamente tem forçado os químicos a escrever e publicar livros, artigos e descobertas valiosas sobre a química e sua filosofia ontológica e metodológica.